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國立清華大學 化學系 孟子青、洪嘉呈所指導 辛杰培的 T細胞酪胺酸去磷酸酶的異位調控:無結構區域造成之自我活性抑制及整聯蛋白alpha-1碳端所促進之酵素活化 (2021),提出lg g2關鍵因素是什麼,來自於晶體結構、蛋白酪氨酸磷酸酶、磷酸酶活性、催化活性、變構調節、自動調節/自動抑制、核磁共振波譜。

而第二篇論文國立臺灣大學 生理學研究所 林水龍所指導 施宏謀的 乙型轉化生長因子透過抑制缺氧誘導因子2α以減少細胞製造促紅血球生成素 (2021),提出因為有 促紅血球生成素、缺氧誘導因子2α、周細胞、肌纖維母細胞、乙型轉化生長因子的重點而找出了 lg g2的解答。

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T細胞酪胺酸去磷酸酶的異位調控:無結構區域造成之自我活性抑制及整聯蛋白alpha-1碳端所促進之酵素活化

為了解決lg g2的問題,作者辛杰培 這樣論述:

T細胞的蛋白酪胺酸磷酸水解酶 (TCPTP, PTPN2) 是在人體細胞中普遍表達的一種非受體型蛋白酪胺酸磷酸水解酶,在不同的細胞間室中有多種不同的作用受質。它調控關鍵訊息傳遞路徑,並與各種癌症生成、發炎反應以及其他人類疾病的發生息息相關。因此,了解TCPTP活性調控的分子機制對於開發針對TCPTP的治療方法至關重要,然而以結構基礎來詮釋TCPTP活性調控機制仍然難以捉摸。在本研究中,我們結合生物物理學以及生物化學的研究方法,進行全面性結構分析,闡明TCPTP活性調控的分子機制。由於TCPTP和PTP1B在PTP家族中是最接近的同源物,可以假設此兩種磷酸水解酶的活性調控是相似的。因此,我們首

先透過X 射線晶體學來探討TCPTP的活性調控是否也存在在PTP1B的變構位點。在解析度分別為1.7Å及1.9Å的TCPTP晶體結構中,我們都觀察到C 端的螺旋 α7。螺旋 α7在PTP1B上是具有功能性且被確定為其變構開關,然而過往研究並未解析螺旋 α7在TCPTP中的功能。此論文中,我們首次證明螺旋 α7發生截斷或刪除時,TCPTP的催化效率會下降約四倍。整體來說,我們的結果證明螺旋 α7的變構角色在TCPTP活性調控之功能與PTP1B相似,且強調螺旋 α7和主要的催化區域的協調對於TCPTP的有效催化功能是必要的。根據晶體結構的觀察分析,我們提出更進一步的問題: 如果TCPTP和PTP1

B的活性催化調控相似,那該如何區分兩者之間活性調控的專一性? 此一問題的釐清對開發TCPTP的藥物有其必要,因此我們繼續專注地研究TCPTP非催化的C側尾端的活化調控。先前的研究已提出TCPTP被自身的C端滅活的假設,但如何造成此結果則仍未知。此外,如果TCPTP表現後無活性,那其如何在細胞內被激活?為了回答這些問題,我們使用核磁共振 (NMR)光譜學、小角度 X 射線散射 (SAXS)以及化學交聯與質譜偶合 (CX-MS)為主要的工具來闡示TCPTP的尾端無結構序列做為分子內自動抑制其酵素活性機制的主要工具。然而,這並不是靠靜態作用造成,而是C端尾部在活化位點周圍移動,以動態遮擋TCPTP的

基質,就像是汽車的”擋風玻璃雨刷”一般的機制。 再者,TCPTP活化是藉由細胞內的競爭來達成,意即Integrin-alpha1無結構尾端序列取代了TCPTP的活性抑制尾端,導致TCPTP的完全活化。我們的工作不僅定義了調控TCPTP活性獨特的機制,同時揭露了兩個極度相近的PTPs (PTP1B與TCPTP) 利用其尾端無結構序列經由截然不同的機制調控其酵素活性。這種獨特的調控機制可以用以發展針對TCPTP專一的治療方式。

乙型轉化生長因子透過抑制缺氧誘導因子2α以減少細胞製造促紅血球生成素

為了解決lg g2的問題,作者施宏謀 這樣論述:

背景:貧血是慢性腎臟病常見的併發症,且和病人預後有關並影響生活品質。腎性貧血最常見的原因是促紅血球生成素(EPO)不足。腎臟製造EPO的細胞是周細胞(pericytes),位於血管周邊,為製造膠原蛋白的細胞,可偵測血氧及血紅素濃度。在纖維化過程中,周細胞增生且分化為α-平滑肌動蛋白陽性(smooth muscle actin+)(α-sma+)的肌纖維母細胞(myofibroblasts),製造病理性細胞外膠原蛋白基質導致腎臟纖維化。Pericytes製造EPO主要透過缺氧誘導因子(Hypoxia-inducible factor) (HIF)2α (HIF2α)活化EPO基因上5’端的增強

子。Pericytes也可以由乙型轉化生長因子(Transforming growth factor-β1)(TGF-β1)刺激分化為myofibroblasts。Myofibroblasts因EPO基因上5’側翼區(flanking region)的高度甲基化而喪失製造EPO的能力。然而當進行pericytes初代培養(primary culture),在繼代2至3代後,它無法維持pericytes的表現型,導致EPO製造能力下降。目前仍沒有理想的細胞株類似於腎臟可製造EPO的細胞,因此對於EPO調控機轉的研究及治療方式的進展受到侷限。以前最常用來研究EPO的製造是使用肝癌的細胞株,Hep3

B和HepG2。然而最近的研究認為,調控肝EPO製造的增強子位於EPO基因的3’端,和調控腎臟EPO的5’端增強子不同。而且腎臟製造EPO的細胞是類似纖維母細胞的pericytes,而不是像上皮細胞的Hep3B和HepG2。方法:我們篩選目前有的老鼠纖維母細胞的細胞株,發現C3H10T1/2(以下簡稱10T1/2)細胞可製造的EPO比NIH/3T3(以下簡稱3T3)細胞更高。於是我們進行10T1/2細胞EPO製造機轉的相關研究,以及探討10T1/2細胞之纖維化基因的變化。我們以定量聚合酶連鎖反應(quantitative PCR)研究這株細胞各種細胞型式的基因表現,也將細胞培養在缺氧環境及正常

氧氣供應環境中,或使用脯胺酸羥化酶結構(Prolyl hydroxylase domain)(PHD)抑制劑誘導HIF,以評估缺氧誘導基因的表現,並以西方墨點法評估HIF1α和HIF2α在10T1/2及3T3細胞中缺氧時的表現。我們也使用針對HIF1α或HIF2α的小干擾RNA(small-interfering RNA)(siRNA)進行基因敲落實驗,研究EPO是藉由何種HIF來調控缺氧誘導基因。為了研究HIF的DNA結合區域,我們使用染色質免疫沉澱法(Chromatin immunoprecipitation),辨認是否HIF1α或HIF2α結合到EPO 5’端增強子、3’端增強子或啟動子

。我們也藉由甲基化特異性PCR (methylation-specific PCR)(MSP)研究10T1/2及3T3細胞的DNA甲基化。另外也研究10T1/2細胞在TGF-β1刺激下如何抑制EPO表現,並延伸至動物實驗。在細胞實驗,我們使用TGF-β1或activin receptor-like kinase-5(ALK5)抑制劑 SB431542研究對TGF-β1–ALK5的下游對EPO-HIF的影響。而我們每天給與老鼠腹腔注射SB431542,並分析整個腎臟及從Col1a1-GFPTg老鼠分離col1a1-GFP+ pericytes,在動物實驗驗證整個理論基礎。結果與討論:和peric

ytes一樣,10T1/2細胞在TGF-β1刺激後分化為α-sma+ myofibroblasts。siRNA實驗亦證實和腎臟製造EPO的細胞一樣,10T1/2細胞也是藉由HIF2α來誘導EPO產生。然而,我們研究發現TGF-β1抑制產生HIF2α蛋白的Epas1基因,主要是藉由活化ALK5,而降低缺氧或PHD抑制劑誘導的EPO產生。在動物實驗方面,老鼠進行輸尿管結紥手術(Unilateral Ureteral Obstruction)(UUO)引發腎臟纖維化損傷,讓腎臟以及myofibroblasts的Tgfb1基因表現增加,並降低Epas1及Epo基因的表現,且可被ALK5抑制劑SB431

542所恢復。我們先前的研究認為TGF-β1的訊號會在UUO後會立刻增加,且也會在給予72小時後透過pericytes的甲基化抑制EPO的產生。然而本篇的研究証實在給予TGF-β1 24小時後就可抑制Epas1及Epo基因的表現。因此我們提出TGF-β1可以藉由兩個機轉來抑制EPO,在早期是直接抑制基因表現,而後才是由甲基化抑制基因。在老鼠UUO實驗中,不管是第四天的UUO腎臟或myofibroblasts,SB431542藉由抑制ALK5使TGF-β1訊號無法傳遞,可恢復其Epo的表現。結論:10T1/2細胞具有和pericytes一樣的性質,都是藉由HIF2α促使EPO表現。TGF-β1不

僅讓10T1/2細胞具有myofibroblasts的特性,也會抑制Epas1-Epo的產生。本研究也証實了in vivo動物實驗中,TGF-β1對pericytes也有抑制Epas1-Epo的效果。因此抑制TGF-β1-ALK5的訊號可能可以提供新的治療方式讓受損的腎臟恢復EPO製造。