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國立臺灣大學 植物科學研究所 鄭秋萍所指導 蔡詠竹的 番茄microtubule-associated RING E3 ligase 1之功能分析 （2011），提出sqrt全名關鍵因素是什麼，來自於泛素化系統、E3 ligase、微管、青枯病、花粉。
而第二篇論文國立臺灣大學 植物科學研究所 鄭秋萍所指導 陳雅婷的 探討茄科鋅指蛋白與 EAS 基因在病害與非生物性逆境反應之功能 （2010），提出因為有 鋅指蛋白、青枯病菌、乾旱、茄科抗菌蛋白、誘導性啟動子的重點而找出了 sqrt全名的解答。
番茄microtubule-associated RING E3 ligase 1之功能分析
為了解決sqrt全名 的問題，作者蔡詠竹 這樣論述：
我們先前發現一功能未知之番茄C3H2C3 type RING E3 ubiquitin ligase，將之命名為SlREL1 (Solanum lycopersicum RING E3 Ligase 1)。SlREL1可能參與番茄抗青枯病品系H7996之防禦反應，其表現在花與熟果較高，且其蛋白產物可能坐落在細胞骨架上。本研究旨在進一步探討SlREL1與其同源基因之蛋白質特性及功能。序列比對結果發現番茄有另一REL基因(SlREL2)；此兩蛋白質在其C端除了保守的RING domain外，也同時有一序列保守但功能未知的DAR1 domain (domain associated with RI
NG 1)。SlREL1被預測具有一進核訊號與許多可能可被激酶進行磷酸化的區域。微管螢光標定物與微管聚合抑制劑試驗確認SlREL1坐落在微管網路上，且其胺基酸片段1-170為必要區段。In vitro self-ubiquitination assay證實SlREL1具有E3 ligase活性，且RING和DAR1 domains在其活性上具關鍵角色。SlREL1-RNAi轉殖番茄之青枯病抗性提高，且其花粉萌發情形較為遲緩，而過量表現SlREL1的轉基因菸草其青枯病病程發展則略為提早。根據短暫基因靜默與過量表現試驗結果初步推測SlREL1在乾旱、鹽害及氧化逆境反應也許不具關鍵功能。此外，阿拉伯
芥有三個REL基因(AtREL1、AtREL2及AtREL3)，且其蛋白質產物在C端亦具有保守的RING domain與DAR1 domain；阿拉伯芥微陣列資料顯示AtREL1/2之轉錄表現在花粉中最高且會受許多病害與非生物性逆境因子調控，而AtREL3表現則較不受這些因子影響。此外，AtREL1也在細胞中呈現絲狀分布，且亦具有E3 ligase活性。這些結果指出SlREL1為一坐落在微管上之E3 ligase，其RING與DAR1 domain皆參與其酵素活性之維持，且阿拉伯芥AtREL1亦具有與SlREL1類似的蛋白質特性。SlREL1可能參與花粉萌發與青枯病反應。
探討茄科鋅指蛋白與 EAS 基因在病害與非生物性逆境反應之功能
為了解決sqrt全名 的問題，作者陳雅婷 這樣論述：
植物生長常會遭受生物性與非生物性逆境的影響，其中由 Ralstonia solanacearum 引起之青枯病 (bacterial wilt, BW) 與缺水逆境 (water deficit, WD) 更是造成全球作物生產重大損失的重要因子。本研究針對番茄 SlZFP 基因 (C3HC4-RING zinc finger type) 與茄科抗菌蛋白合成之關鍵酵素 5-Epi-aristolochene synthase (EAS) 在病害與非生物逆境反應之功能進行探討。首先，先前短暫靜默番茄 SlZFP 基因詴驗發現此基因參與番茄抗青枯病機制中，本研究進一步發現在正常生長條件下，SlZF
P 蛋白主要表現在花及成熟果實，蛋白質則坐落於細胞骨架；在抗/感品系處理青枯病菌及各式病原相關物質後，SlZFP 在轉錄層次之表現皆受到抑制，但不受乾旱逆境或荷爾蒙調控。此外，SlZFP 基因被靜默後導致番茄較不耐乾旱，而過量表現 SlZFP 可使轉基因菸草植株更抗青枯病菌、缺水、氧化逆境和鹽害，且在正常生長條件下其 SA 路徑相關防禦基因之表現已明顯提升。綜合以上結果證實 SlZFP 基因在青枯病和多種非生物逆境防禦反應中皆扮演正面的重要角色。另一方面，當 SlZFP 之阿拉伯芥同源基因 At5g24870 基因缺失時，其種子萌芽率在鹽害、模擬乾旱、糖分、滲透壓及 ABA 等逆境下皆較低，但
並不影響對青枯病與軟腐病菌之反應，顯示 At5g27870 基因在植物對抗多數非生物逆境上亦具正面功能。第二部分的研究係探討茄科 EAS 基因在逆境反應之功能，先前研究短暫靜默番茄 SlEAS 基因詴驗發現此基因參與番茄抗青枯病機制中，本研究進一步發現過量表現煙草 NtEAS 之轉基因菸草可更抗青枯病菌、氧化逆境和鹽害，且其 SA 路徑相關防禦基因之表現亦明顯提升。此外，先前研究顯示在不同煙草品種中，以 Nicotiana glutinosa EAS (NgEAS) 基因受青枯病菌及氧化逆境誘導表現最為顯著，經進一步釣取啟動子序列並分析後發現，NgEAS 啟動子可受多種重要植物病原菌與病原相關
物質誘導，並經由維管束傳導達成系統性的表現，而 GT-1 box 為誘發訊號傳遞之必需 cis-element。綜合本研究顯示 SlZFP 與 EAS 基因在青枯病、乾旱、氧化逆境和鹽害逆境防禦反應皆具正面功能，除在學術上提供更多關於植物抗逆機制的重要資訊外，未來也可將之應用在培育抗病/逆新品種的研發工作上。