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探討候選基因ADHFE1及PRDM14甲基化狀態與 大腸直腸癌患者預後之關聯性

為了解決lineage os中文的問題，作者曾嘉聆 這樣論述：

背景近年來，由於生活品質提高、飲食結構的改變等因素，導致大腸直腸癌的發生率及死亡率不管是在全球還是台灣皆名列前茅。目前已將表觀遺傳學的生物標記物運用在醫學臨床上，找出與該疾病有關的候選基因，對其基因或附近的變異體進行關聯性研究，將能幫助醫師對大腸直腸癌患者更精準的用藥及擬定合適的治療方案，進而改善大腸直腸癌患者的生活品質及提高存活率。目的探討大腸直腸癌患者鄰近周邊正常組織和腫瘤組織檢體兩者候選基因ADHFE1的甲基化狀態和程度及PRDM14的甲基化狀態與患者預後之關聯性。方法本研究之研究設計為自我對照研究與世代追蹤研究，研究對象為三軍總醫院同意參與本研究之大腸直腸癌病患且有進行大腸直腸癌切除

手術，排除條件為手術時腫瘤組織檢體過小之患者。使用Kaplan-Meier法及Cox Regression Model來比較大腸直腸癌患者鄰近周邊正常組織和腫瘤組織候選基因甲基化狀態及程度對大腸直腸癌患者預後之情形(預後指標包括無復發存活(Recurrence-Free Survival, RFS)、無進展存活率(progression-free survival, PFS)、總存活率(overall survival, OS)三個指標進行評估)。結果在大腸直腸癌患者鄰近周邊正常組織和腫瘤組織中發現ADHFE1基因甲基化狀態和程度皆與預後的三項指標無關且皆呈現保護作用，統計上皆無顯著。另外，在

腫瘤組織中，PRDM14基因有甲基化者其預後的三項指標風險較高，經臨床變項校正後的Hazard ratio(HR) (95% Confidence interval[CI])分別為1.766(0.923-3.377)、1.701(0.914-3.165)和2.131(0.718-6.326)。結論與未甲化組相比，PRDM14基因甲基化組其五年無復發存活率、無進展存活率及總存活率的風險較高，建議未來可再進一步研究。而ADHFE1基因在腫瘤組織中其預後三項指標皆呈現保護作用，統計上皆無顯著。PRDM14基因有潛力成為大腸直腸癌預後預測之甲基化生物標記。

台灣西南海域四方圈合海脊冷泉底泥之甲烷盤菌屬新種純化及特性分析

為了解決lineage os中文的問題，作者周揚智 這樣論述：

冷泉(cold seep)生態系為深海底棲生物多樣性的綠洲，不似非冷泉區仰賴海洋雪(marine snow)作為物質與能量來源。冷泉生態系以甲烷(methane)、硫化物(sulfide)等還原性化學物質為基礎，不少原核生物(prokaryote)，如硫酸根還原菌(sulfate reducing bacteria)、好氧甲烷營養菌(aerobic methanotrophic bacteria)、厭氧甲烷營養古菌(anaerobic methanotrophic archaea, ANME)與甲烷古菌(methano-archaea)能利用這些物質，並透過營養層階(trophic casc

ade)或共生關係(symbiosis)將這些物質與能量傳遞給大型底棲動物。甲烷古菌可將各式無機與有機化合物如二氧化碳、氫氣、乙酸鹽(acetate)與甲醇(methanol)等物質轉換為甲烷，為冷泉生態系碳循環不可或缺的要素之一，因此純化單一甲烷古菌菌株並分析其形態生理與基因體特性，可更了解這類獨特的生態系。本研究以純化自四方圈合海脊的甲烷古菌FWC-SCC4為研究對象，菌株FWC-SCC4之細胞形態為直徑0.8到1.2 μm的類球菌(coccoid)且具有複數鞭毛，與其親緣最接近的物種為Methanoplanus limicola M3T，兩者的16S rRNA基因相似度為96.08%。此

菌株必需有酵母萃取(yeast extract)才可生長且為氫營養型(hydrogenotrophic)甲烷古菌，可利用氫氣與二氧化碳或甲酸鹽(formate)產生甲烷。生長最適條件為37℃、0.09 M氯化鈉與pH值7.01。表層(surface layer, S-layer)蛋白分子量為136.65 kDa。基因體方面，菌株FWC-SCC4基因體長2.3 Mbp，與Methanoplanus limicola M3T的ANI以及GGD分別為69.89以及19.8%。基因體共線性(synteny)分析指出菌株FWC-SCC4有4條16S rRNA基因，比較基因體分析顯示菌株FWC-SCC4相

較於Methanoplanus limicola M3T與Methanolacinia petrolearia SEBR 4847T獨有opuABCD基因與一組完整的IC亞型Cas系統與2套CRISPR。